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胃癌治疗中驱动转录因子的筛选

简介：许光中，李凯，张能维，樊庆，廉东波，刘晨，张东东 （首都医科大学附属北京世纪坛医院胃肠肝胆外科 北京 １０００３８） 〔摘要〕目的：寻找对胃癌影响最关键的转录因子并构建转录调节网络为治疗胃癌提供额外的线索。方法：从基因表达数据库中下载胃癌基因表 达谱寻找差异表达基因，在基因本体论和京都基因富集和基因组百科全书通路中富集分析，并构建转录调控网络。结果：筛选出 ２３２７个差异表达基 因，构建了 ５６６个相互作用的转录因子靶点的转录调控网络，ＢＲＣＡ１，ＡＲＩＤ３Ａ，ＥＨＦ等十个基因在胃癌的发生中起关键作用。结论：１、通过综合分析 基因组数据库寻找到关键转录因子，可以帮助阐明胃癌发生的潜在调节机制 ２、通过胃癌及癌旁组织标本进行验证，建立肿瘤转录调控网络切实可行。 关键词：〔《中国组织化学与细胞化学杂志》2019年8月 28卷 临床医学专集〕差异表达基因 基因表达数据库 基因本体论 转录因子 京都基因和基因组百科全书

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